MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019680	TGA	2	6	6	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019680	ATT	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019680	GCAA	2	8	18	25	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019680	A	6	6	24	29	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019680	CTC	3	9	181	189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711180
6	NC_019680	GCC	2	6	191	196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711180
7	NC_019680	TGG	2	6	254	259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711180
8	NC_019680	ATG	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711180
9	NC_019680	TCC	3	9	408	416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711180
10	NC_019680	AATC	2	8	439	446	50 %	25 %	0 %	25 %	427711180
11	NC_019680	T	6	6	518	523	0 %	100 %	0 %	0 %	427711180
12	NC_019680	GGA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711180
13	NC_019680	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711180
14	NC_019680	AAG	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711180
15	NC_019680	GGT	2	6	897	902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711180
16	NC_019680	C	6	6	918	923	0 %	0 %	0 %	100 %	427711180
17	NC_019680	A	6	6	1030	1035	100 %	0 %	0 %	0 %	427711180
18	NC_019680	ATT	2	6	1234	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711180
19	NC_019680	CGG	2	6	1297	1302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711180
20	NC_019680	GAA	2	6	1381	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711180
21	NC_019680	GGC	2	6	1390	1395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711180
22	NC_019680	CCG	2	6	1514	1519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711180
23	NC_019680	CTA	4	12	1766	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019680	AAG	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019680	TAG	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019680	A	7	7	1821	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019680	GTA	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019680	T	6	6	1956	1961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019680	CTG	2	6	1966	1971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019680	TTG	2	6	2016	2021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019680	A	8	8	2147	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019680	ACTT	2	8	2290	2297	25 %	50 %	0 %	25 %	427711181
33	NC_019680	GTTGG	2	10	2298	2307	0 %	40 %	60 %	0 %	427711181
34	NC_019680	CG	3	6	2362	2367	0 %	0 %	50 %	50 %	427711181
35	NC_019680	CACAA	2	10	2391	2400	60 %	0 %	0 %	40 %	427711181
36	NC_019680	AATC	2	8	2462	2469	50 %	25 %	0 %	25 %	427711181
37	NC_019680	TCA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711181
38	NC_019680	GGTA	2	8	2510	2517	25 %	25 %	50 %	0 %	427711181
39	NC_019680	T	6	6	2532	2537	0 %	100 %	0 %	0 %	427711181
40	NC_019680	ACGGA	2	10	2557	2566	40 %	0 %	40 %	20 %	427711181
41	NC_019680	ATC	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711181
42	NC_019680	T	6	6	2625	2630	0 %	100 %	0 %	0 %	427711181
43	NC_019680	GTG	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711181
44	NC_019680	CAT	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711181
45	NC_019680	GGT	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711181
46	NC_019680	CCG	2	6	2816	2821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711181
47	NC_019680	GAA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711181
48	NC_019680	A	7	7	2950	2956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019680	GTCG	2	8	3001	3008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019680	TGA	2	6	3045	3050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019680	TCA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019680	CTGAT	2	10	3137	3146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019680	TCTGA	2	10	3147	3156	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019680	TGG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019680	A	6	6	3237	3242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019680	GAG	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019680	TAT	2	6	3286	3291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019680	C	6	6	3366	3371	0 %	0 %	0 %	100 %	427711182
59	NC_019680	ATT	2	6	3377	3382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711182
60	NC_019680	CCA	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711182
61	NC_019680	GAA	2	6	3509	3514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711182
62	NC_019680	ATT	2	6	3515	3520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711182
63	NC_019680	GCG	3	9	3521	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711182
64	NC_019680	G	6	6	3529	3534	0 %	0 %	100 %	0 %	427711182
65	NC_019680	GA	3	6	3663	3668	50 %	0 %	50 %	0 %	427711182
66	NC_019680	TGA	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711182
67	NC_019680	C	6	6	3746	3751	0 %	0 %	0 %	100 %	427711182
68	NC_019680	GCT	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711182
69	NC_019680	ATT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711182
70	NC_019680	AGGG	2	8	3885	3892	25 %	0 %	75 %	0 %	427711182
71	NC_019680	TGG	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711182
72	NC_019680	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711182
73	NC_019680	GTG	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711182
74	NC_019680	GCA	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711182
75	NC_019680	GCC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711182
76	NC_019680	TTTG	2	8	4108	4115	0 %	75 %	25 %	0 %	427711182
77	NC_019680	CCTGTT	2	12	4227	4238	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427711182
78	NC_019680	AACC	2	8	4422	4429	50 %	0 %	0 %	50 %	427711182
79	NC_019680	GCTT	2	8	4443	4450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019680	GCC	2	6	4474	4479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711183
81	NC_019680	T	6	6	4491	4496	0 %	100 %	0 %	0 %	427711183
82	NC_019680	CG	3	6	4505	4510	0 %	0 %	50 %	50 %	427711183
83	NC_019680	AAAT	2	8	4602	4609	75 %	25 %	0 %	0 %	427711183
84	NC_019680	GGT	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711183
85	NC_019680	TCA	2	6	4733	4738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711183
86	NC_019680	ACT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711183
87	NC_019680	TAA	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711183
88	NC_019680	CTG	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711183
89	NC_019680	GAA	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711183
90	NC_019680	TTC	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711183
91	NC_019680	TGG	2	6	5037	5042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711183
92	NC_019680	CAC	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711183
93	NC_019680	GCT	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711183
94	NC_019680	AGG	3	9	5120	5128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711183
95	NC_019680	TTC	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711183
96	NC_019680	GTTTG	2	10	5190	5199	0 %	60 %	40 %	0 %	427711183
97	NC_019680	GTT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711183
98	NC_019680	TGG	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711183
99	NC_019680	GTTT	2	8	5276	5283	0 %	75 %	25 %	0 %	427711183
100	NC_019680	GTT	2	6	5484	5489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711183
101	NC_019680	GGC	2	6	5524	5529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711183
102	NC_019680	CGTTGA	2	12	5660	5671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427711183
103	NC_019680	ATA	2	6	5721	5726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711183
104	NC_019680	CGG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711183
105	NC_019680	AG	3	6	5805	5810	50 %	0 %	50 %	0 %	427711183
106	NC_019680	ATA	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711183
107	NC_019680	TCAC	2	8	5926	5933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019680	CAC	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019680	ATAGAC	2	12	6029	6040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427711184
110	NC_019680	CCA	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711184
111	NC_019680	ATC	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019680	ATG	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019680	T	6	6	6268	6273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019680	CTG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711185
115	NC_019680	CAA	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711185
116	NC_019680	ATTA	2	8	6506	6513	50 %	50 %	0 %	0 %	427711185
117	NC_019680	GGC	2	6	6536	6541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711185
118	NC_019680	GGC	2	6	6623	6628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711185
119	NC_019680	TAA	2	6	6652	6657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711185
120	NC_019680	GCC	2	6	6699	6704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711185
121	NC_019680	ATTGG	2	10	6715	6724	20 %	40 %	40 %	0 %	427711185
122	NC_019680	CACC	2	8	6772	6779	25 %	0 %	0 %	75 %	427711185
123	NC_019680	TCT	2	6	6792	6797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711185
124	NC_019680	TGGG	2	8	6869	6876	0 %	25 %	75 %	0 %	427711185
125	NC_019680	AAGT	2	8	6894	6901	50 %	25 %	25 %	0 %	427711185
126	NC_019680	CTG	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711185
127	NC_019680	GAG	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711185
128	NC_019680	AGA	2	6	7092	7097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711185
129	NC_019680	TAA	2	6	7117	7122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711185
130	NC_019680	GAG	2	6	7171	7176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711185
131	NC_019680	ATC	3	9	7193	7201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711185
132	NC_019680	TCTG	2	8	7425	7432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019680	CAC	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019680	AGT	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711186
135	NC_019680	AGC	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711186
136	NC_019680	CCA	2	6	7656	7661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711186
137	NC_019680	AC	3	6	7662	7667	50 %	0 %	0 %	50 %	427711186
138	NC_019680	GAA	2	6	7710	7715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711186
139	NC_019680	AAC	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019680	GCGG	2	8	7832	7839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019680	GAT	2	6	7881	7886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019680	CCTAGT	2	12	7978	7989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427711187
143	NC_019680	GTA	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711187
144	NC_019680	TGAT	2	8	8067	8074	25 %	50 %	25 %	0 %	427711187
145	NC_019680	TTGCC	2	10	8091	8100	0 %	40 %	20 %	40 %	427711187
146	NC_019680	GAT	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711187
147	NC_019680	GCT	2	6	8120	8125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711187
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149	NC_019680	ACG	2	6	8210	8215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711187
150	NC_019680	TCT	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019680	TGGGCC	2	12	8427	8438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711188
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153	NC_019680	TTC	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711188
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163	NC_019680	TGT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711189
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167	NC_019680	CCA	2	6	9389	9394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711189
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172	NC_019680	ATT	2	6	9730	9735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019680	CTG	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_019680	GCT	2	6	9776	9781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711190
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253	NC_019680	AG	3	6	13822	13827	50 %	0 %	50 %	0 %	427711191
254	NC_019680	AAG	2	6	13919	13924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711191
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256	NC_019680	AGA	2	6	14091	14096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711191
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258	NC_019680	AAC	2	6	14344	14349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711192
259	NC_019680	GGCCT	2	10	14392	14401	0 %	20 %	40 %	40 %	427711192
260	NC_019680	CAG	2	6	14427	14432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711192
261	NC_019680	GTT	3	9	14439	14447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711192
262	NC_019680	CAAT	2	8	14540	14547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
263	NC_019680	AGA	2	6	14609	14614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019680	AT	3	6	14707	14712	50 %	50 %	0 %	0 %	427711193
265	NC_019680	TC	3	6	14722	14727	0 %	50 %	0 %	50 %	427711193
266	NC_019680	T	6	6	14737	14742	0 %	100 %	0 %	0 %	427711193
267	NC_019680	TTG	2	6	14772	14777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711193
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269	NC_019680	CT	3	6	14963	14968	0 %	50 %	0 %	50 %	427711194
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400	NC_019680	CCA	2	6	22067	22072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711200
401	NC_019680	TAA	2	6	22080	22085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711200
402	NC_019680	CGT	2	6	22093	22098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711200
403	NC_019680	CTGGGC	2	12	22176	22187	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711200
404	NC_019680	GCT	2	6	22243	22248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711200
405	NC_019680	CGA	2	6	22355	22360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711200
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434	NC_019680	TCAT	2	8	23674	23681	25 %	50 %	0 %	25 %	427711200
435	NC_019680	ACC	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711200
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437	NC_019680	TTTGA	2	10	23879	23888	20 %	60 %	20 %	0 %	427711200
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